Alle iPhone SE-modellen (3e generatie) hebben een 4,7-inch (diagonaal) breedbeeld multitouch "True Tone" LED-backlit 1334x750 "Retina HD"-scherm met native resolutie (326 ppi, 625 cd/m2) en een taptic- door een motor aangedreven solid-state "klikloze" Home-knop.

Het heeft twee camera's: een 12-megapixel 4K-camera aan de achterzijde met optische beeldstabilisatie, een diafragma van f/1.8, een lens met 6 elementen en nieuwe "computationele fotografievoordelen, waaronder Smart HDR 4, fotografische stijlen, 
Deep Fusion en portretmodus" - evenals een 7-megapixelcamera aan de voorkant met ondersteuning voor 1080p-video. 

De camera's ondersteunen bewegingsregistratie en bieden ook ondersteuning voor augmented reality.

De iPhone SE (3e generatie) maakt gebruik van een behuizing van aluminiumlegering van "lucht- en ruimtevaartkwaliteit" en heeft een glazen voor- en achterkant. Hij is spat-, water- en stofbestendig (IP67) maar niet volledig waterdicht, en beschikt over stereospeakers en een Lightning-poort. 
Deze uitvoering is in de kleur Zwart
Intern wordt de iPhone SE (3e generatie) aangedreven door een 3,2 GHz "Apple A15 Bionic"-processor met zes cores (twee prestatie-cores en vier efficiëntie-cores) en een 16-core Neural Engine. Het heeft 4 GB RAM en 64 GB flash-opslag. 

Het ondersteunt ook 802.11ax Wi-Fi 6 met 2x2 MIMO, 5G draadloos (maar niet mmWave), Bluetooth 5.0", NFC voor Apple Pay, "Express Cards met gangreserve" voor compatibele vervoerssystemen en ondersteuning voor Dual SIM (één hardware nano-simkaart en één softwaregebaseerde eSIM).